Biblissima+ est construit et régulé par un Comité de direction composé des représentants de toutes les équipes fondatrices.
Il se réunit au moins deux fois par an. Lors de sa réunion de printemps, il désigne les lauréats des appels à projets Biblissima+, après examen et classement des candidatures par le Conseil scientifique de Biblissima+.